[Biology 생물학] global-단백질, 효소,원형질막 내용 정리

교재: Gerald Karp spanish eddition 7ma

-Cap 2 : proteina~

-Cap 3: 3.2

-Cap 4: 4.1 ~ 4.6

 

Proteina: moleculas que realizan Todas las actividades celulares)

 

-herramientas/ maquinas moleculares que permiten que los eventos SUCEDAN

FUNCIONES

 -acelerador de las reacciones METABOLICAS 대사작용 촉매작용 (Como enzima)

 -Brindan Soporte Mecanico en la celulas, y su periferia 주변 (cable estructural)

 -funcion como receptor de membrana y transportador (세포의 작용, 물질의 출입에 관여)

 -constituyen la maquinaria de movimientos biologicos ( Filamento contractil 수축력 있는 가는 섬유, motores moleculares 분자의 움직임)

CARACTERISTICAS

-Sus funciones variadas vienen de su monomero AMINOACIDO (Carac. quimicas 화학적 특성)

  -Estructura de aminoacido: Carboxilo(-COOH) / Amino (-NH3), con un SOLO ATOMO DE CARBONO EN EL CENTRO, en la solucion acuosa: carboxilo pierde su Proton, carga negativa(-) , Amino GANA un proton, carga positiva (+)

  -esteroisomero de a.a (D, L - Dependiendo de la presencia de CH3, un metilo)

ex)

L- Alanina	D-Alanina
-sintetizan proteina en un RIBOSOMA (RNA의 효소)	-MICROORGANISMO, En la sintesis de ciertos peptidos pequenos, como Pared celular, antibiotico 항생제 (gramicidina A)

-Union de aminoacido:

      ENLACE PEPTIDICO: creado por la union de carboxilo, con el grupo amino de su vecino, ELIMINANDO una molecula de AGUA!

      UNA Cadena polipeptidica promedio: 450 a.a ( But, mas largo polipeptidico de PROTEINA MUSCULAR tinina :30.000 a.a)

      RESIDUO: Se dominan a los a.a. despues de la union de cadena polipeptidica.

-Las proteinas puede contener otro tipo de componente despues de su sintesis

• Glucoproteina- carbohidrato
• Metaloproteina- Metal
• Flavoproteina- Grupo organico

caracteristicas variada de cadena lateral(Grupo R)

-a.a. : se clasifican segun sus caracteristicas de sus cadenas laterales

-son importante paras

• las interacciones intramoleculares(분자내 상호작용): Determinan la estructura y actividad de la molecula
• las interacciones Intermoleculares(분자외 상호작용): Determinan la relacion de un polipeptido con otras moleculas(o otro polipeptidos)

polares con carga (+) DE ACIDO GLUTAMICO(E) ACIDO ARPARTICO(D) (-) KRH (hi korea) LISINA (K) ARGININA (R) HISTIDINA (H) enlace ionicos- reacciones quimicas	polares Sin carga Si Te Quiero Nuna Y vos?  SERINA (S) Teonina (T) Glutamina (Q) Asparagina(N) Tirosina(Y) puente H- CON AGUA
NO POLARES A아 제발 V빨 L리 I M F W 아 제발 빨리 I'm FW ALANINA(A) VALINA(V) LEUCINA(L) ISOLEUCINA(I) METIONINA(M) FENILALANINA(F) TRIPTOFANO(W) CADENA LATERAL HIDROFOBA - 수용성 단백질(proteina soluble)에서 중심을 이루는 경향, 물과 멀리 묻혀있다( sepultado) 막에서 중요한 역활을 한다-이중층과 연결되기 때문에	propiedades unicas GLICINA(G)-HIDROFILO/HIDROFOBO 유일하게 NO UNE CON 4GRUPOS DISTINTOS!!) cisteina(C)-UNICA PROPIEDAD UNICA, CREA UN ENLACE COVALENTE CON OTRA CISTEINA-ENLACE DISULFURO prolina(P)-HIDROFOBA CREA DOBLECES EN LA CADENAS POLIPEPTIDICAS, ALTERAR ESTRUCTURA SECUNDARIA ORDENADA

요점정리

• distancia de dos uniones peptidicas:  0.35nm(3.5A) aproximanadamente

1nm-10A

• proteinas fibrosas: poseen una estructura 3ria-insoluble en agua, generalmente son de 4ria
• proteinas globulares: forma esferias, soluble en agua-3ria
•  
• grupos prosteticos: porciones no proteicas unidas a las estructuras proteicas (ej: Hemo de hemoglobina)
• fosfolipasa C: 4 dominios distintos, estructura 3ria
• subunidades 1개이상: 4ria,
• dominio:3ria,
• segmento:2ria
• polipeptido:1ria
• al colocar una proteina sanguinea desplegada a un ambiente acuoso, SE PLIEGA Y ADOPA SU CONFIGURACION NATIVA PARTICULAR
• estructura terciaria: CRISTALOGRAFIA DE RAYO X : 단백질의 구조 결정하는데 사용, 형태는 X
• NMR 핵자기 공명: 단백질 형태변화에 대한 정보 제공
• Estructura terciaria:sufre plegamiento por el relacionamiento quimico de aa. localizados distalmente en la misma cadena

n de polipeptido(enlace) = (n de a.a)-(n de cadena)

 

• proteinas globulares/fibrosas

 

proteinas globulares	proteinas fibrosas
hemoglobina,enzima, hormona, anticuerpo, mioglobina BETA-TGF, Fosfolipasa C, Ribonucleasa	바깥부분!! quaratina, seda, colegeno, elastinas

carga negativa (-) a.a.

DE

ACIDO GLUTAMICO (E)

ACIDO ASPARTATO-ASPARTICO (D)

monomeria-1 subunidad (3ria)

2 subunidades- iguales- homodimericas, diferentes-heterodimericas (4rias)

cambio comformacion: implica un cambio predecible y transitorio de la estructura 3ria de una proteina

A.a. esenciales: FILMTVHKW: 몸에서 생산되지 않아 섭취해야만 함! 계란, 고기, 우유에 풍부.

Fenilanina, isoleucina, leucina, metionina,treonina,valina,histidina,lisina,triptofano

 

PTM(modificacion pos-traduccional): los a.a. que sufren MODIFICACION

 

• enzima hidroxila Pro(p) y Lys(k) :requiere coenzima llamada Acido Ascobico(vitamina C)-estructura del colageno 에 매우 중요!
• enzima que fosfilan Ser(S), Thr(T), Tyr(Y) son cinasas, usan ATP como DONANTE DE FOSFATO!  fosfilacion: puede activar/deactivar proteinas
• o-glicosilacion, n-glicosilacion, ubicuitinacion 도  PTM 의 일종

Insulina: una hormona polipeptídica formada por 51 aminoácidos=2 cadenas polipeptidicas, de 21 y 30 a.a., primera revelada de su secuencia de la estructura primaria

los grupos R de aa.  en una estructura alfa-helice (2ria) : se disponen hacia adentro y hacia afuera de la helice

R apolares: no polares

valina...leucina, isoleucina...

C- Cysteina: propiedad especifica... puente disulfuro, unica que forma enlace covalente!

M- METIONINA!!

 

Prolina

• Es abundante en las regiones al azar, no helicoidales ni laminares
• posee formas D y L debido a su carbono alfa asimetrico
• Su grupo R con naturaleza HIDROFOBA.
• Propiedad unica!
• encaja en los sacos hidrofobicos de los dominios SH3

+) dominio SH3

• se encuentra mas de 200 proteinas distintas
• implicadas en senalizacion molecular
• saco hidrofobos que se llenan con protrusiones
• varios peptidos contiene Prolina ( PI3K Tambien!)

1000 Da=1Kda

Piruvato- deshidrogenasa(relacionado con la interacciones proteicas)

• cataliza reacciones que conectan la glucolisis con el ciclo de acido tricarboxilicos- vias metabolicas...
• es un complejo de 60 subunidades (cadena polipeptidica), todas enzimaticas-3 enzimas distintas
• Es visible al microscopio electrnico
• puede ser hallado en la E. coli
• estructura inestable, ya que tiene un complejo multiproteico

Familia=isoforma: estructura 1ria 는 다르지만 2ria, 3ria 가 비슷할때 (semejante)

ex: familia espectrina: D espectrina...fodrina y distrofina

 

Mescaptoetanol : agente desnaturalizantes, que destroye el puende DISULFURO!

Autoensamble: ribonucleasa: capaz de autoensamblarse- plegamiento de proteinas(63p)

dominio: bloques de una proteina globular que se pligan de manera independiente y poseen funciones semi-independientes

PH : Que se une al lipido

cromodominio: union de K-M

SH3- PROLINA (4RIA)

SH2, PTB: fosfo-Y(tirosina)

 

desnaturalizacion: no es cambio conformacional!!

Distancia entre puente hidrogeno: 1.8A (0.18nm)

 

 

enzimaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa

효소! 촉매작용! 생체촉매